本郷、向ヶ岡、弥生などの町をのせる台地の東縁に位置する弥生時代後期の集落跡である。昭和４９年、東京大学により発掘調査が行われ、丘陵の崖縁に沿う２条の溝が交差して発見され、旧い溝の中に貝層が形成され、そのかたわらに５個体の弥生式土器が検出された。貝層と土器、新しい溝の三者は同一時期に属するものであることが明らかとなるとともに、貝層を構成する貝が鹹水産の貝類からなることが知られるに至り注目をひいた。
　検出された２条の溝は幅２メートル前後をはかるものであるが、おそらく最近関東地方でも例の増加しつつある崖縁などの地形を巧みに利用し集落を囲む環濠例の一つか、あるいはそれに関連する溝かと考えられるものである。西方の台地上に住居の存在が推測されるが、貝層の堆積もその間の情況を暗示している。
　明治１７年、有坂〓(*1)蔵によって向ヶ岡貝塚から１点の完形に近い壺形土器が発見され、この地がのちに弥生町となったこともあり、この種の土器を弥生式土器と呼称し今日に至ったが、この発見地たる向ヶ岡貝塚は位置が不明となって、数か所の推測地があり、内にはきわめて強い可能性をもつ地もある。本遺跡をその一つとする見解もあるが同様推測にとどまるものと考えられる。しかし近接した同時期の遺跡として、またこの地域の旧観をしのばせる唯一の地点でもあり、東京都心部における弥生時代の数少ない貝塚を伴う遺跡としてきわめて重要である。