萩藩主毛利家の墓所は、大照院隣接地と東光寺隣接地にある。毛利輝元の子の初代藩主秀就は、慶安４年（１６５１）、萩城で没し、天樹院で火葬されたあと歓喜寺に葬られた。２代藩主綱広は、亡父のため、承応３年、歓喜寺の改修に着手し、明暦２年（１６５６）に完工した。この時、秀就の法号大照院に因んで寺名を大照院と改めた。大照院は臨済宗の寺で、延享４年に火災のため全焼し、６代藩主宗広の時、寛延３年に再建した。東光寺は、３代藩主吉就が、元禄３年に創建した黄檗宗の寺である。
　東光寺の創立以降、歴代藩主は大照院の両寺に交互に葬られることとなった。即ち、大照院には、初代藩主秀就・２代藩主綱広・４代藩主吉広・６代藩主宗広・８代藩主治親・１０代藩主斉熙・１２代藩主斉広の７藩主が、東光寺には、３代藩主吉就・５代藩主吉元・７代藩主重就・９代藩主斉房・１１代藩主斉元の５藩主が葬られた。
　大照院の墓所は、大きく５群に分かれている。墓所内の墓の数は５２基で、藩主の墓７基を除いた４５基は、藩主室、一族、殉死者等のものである。墓標は、改葬墓１基、新墓２基を除いて、花崗岩製の五輪塔型で統一され、水輪に普の字を、地輪の表には法号、その裏に没年月日を刻むのを原則としている。墓の大きさも藩主夫妻と一族等の２種類に分けてほぼ統一され、藩主夫妻のそれはとくに大型である（総高約４．５メートル）。墓の周囲には玄武岩製の石柱玉垣がめぐらされており、藩主の玉垣の内側と外側には青栗石が敷きつめられている。藩主墓の参道にはそれぞれ鳥居（計７基）が建っていることも特徴である。また、墓所内には、６０５基の石燈籠がある。
　東光寺の墓所は、大きく４群に分かれている。墓所内にある墓の数は４０基で、藩主の墓５基を除いた３５基は、藩主室、一族等のものである。墓標は大照院とは異なり、花崗岩製の唐破風笠石付方柱型（藩主夫妻の墓の総高は約４．４メートル）で統一され、墓石には法号が、笠石には藩主夫妻の場合には澤潟紋が刻まれているが、没年月日は刻まれていない。墓は、大照院と同様、石柱玉垣で囲まれ、藩主墓の参道には各々鳥居（計５基）が建っているほか、藩主の墓前には、生前の業績を記した砂岩製の神道碑が亀跌の上に立っている。墓所内は、参道・石段は、大照院・東光寺とも玄武岩で造られている。
　この両墓所は、明治初年にそれぞれ大照院・東光寺から分離され（東光寺の墓所は明治４年）、毛利氏の所有となり、現在に至っている。
　毛利輝元は、慶長５年の関ヶ原の戦いの際、主将におされて豊臣方についた。このため、中国８か国１２０万余石を領していた毛利氏は、周防・長門２ヶ国３６万９千石に削封され、輝元は、同年１０月、その責をとって隠居し、子の秀就がわずか６歳で家督を嗣いで萩に移った。寛永２年（１６２５）、輝元が没すると、天樹院に葬られた。旧天樹院には、五輪塔型、花崗岩製の輝元夫妻の墓、秀就火葬跡が残っている。
　萩藩主毛利家墓所は、大照院・東光寺ともに、山林を背にして広大な地域に整然と配置され、その規模の大なることといい、荘厳幽邃なことといい、近世大名墓所の代表的なものであり、大名の墓制・葬制を知る上で重要である。今回こうした歴史的重要性にかんがみ、境内地を含めた大照院の墓所、同じく東光寺の墓所、旧天樹院の輝元墓所を一括し、萩藩主毛利家墓所として史跡に指定する。